Toen Alien van Ridley Scott voor het eerst werd uitgebracht in 1979, was de franchise een viscerale horrorfilm met een science fiction-esthetiek. Het was een zanderig en relatief eenvoudig uitgangspunt dat meesterlijk werd uitgevoerd en meteen lovende kritieken kreeg. De franchise bouwde voort op dit succes door de reikwijdte uit te breiden, het actiespektakel en de horror te versnellen door de kerndynamiek in Aliens van James Cameron te militariseren. Prometheus verbreedde het toepassingsgebied nog verder, door vragen te durven stellen over de aard van de schepping. Alien: Covenant wil de twee helften van deze franchise op meer dan één manier samensmelten, door het scherm met gore te bespatten terwijl we de complexe mythologie van het gelijknamige wezen uitdiepen en uiteindelijk antwoorden waar ze vandaan komen.
De gebeurtenissen van Prometheus leken te suggereren dat de xenomorph ten minste gedeeltelijk een creatie van de mysterieuze ingenieurs was. De terugkerende regisseur Scott heeft die theorie echter tenietgedaan door fans te plagen voorafgaand aan de release van de zesde film in de franchise.
In een interview met Collider (via IBT) besprak Scott de aard van Alien: Covenant en waarom dit nu het juiste moment is om een vraag te beantwoorden die fans sinds het origineel meer dan 30 jaar geleden heeft lastiggevallen:
"Het had niet echt moeten eindigen, dus we zijn teruggekomen met een heel simpel idee: wie heeft ze gemaakt? [Alien] was er zo ongeveer; het bestaat. En dit is wat het is …
Dus we hebben het idee van Alien opnieuw uitgevonden, denk ik, namelijk dat Verbond ons een stap dichter brengt bij wie en waarom dit ding is ontworpen om mensen te maken. En als je denkt dat zij het zijn [de Engineers], heb je het helemaal mis."
Scott's openhartige opmerkingen plagen een veel groter plot dan het origineel met zich meebracht, met de suggestie dat deze film kijkers een "stap dichterbij" brengt bij het begrijpen van de aard van de wezens, erop wijzend dat het publiek deze keer niet alle antwoorden zal ontvangen. Het vervolg op Covenant is al geschreven, dus het is waarschijnlijk dat deze kernvraag de twee films dwars zal zitten. Hoewel dat fans kan frustreren die hoopten op een aantal concrete antwoorden, zijn er geruchten begonnen te circuleren over de evolutionaire keten die mensen, de ingenieurs en de xenomorfen verbindt.
Er is een suggestie (geplaatst op Alien-Covenant.com) dat een hogere macht mensen, ingenieurs en 3-4 andere iteraties van mensachtigen in vele universums heeft voortgebracht. Deze hogere wezens hebben zogenaamd goddelijke krachten, waaronder de kracht om massale natuurrampen op te wekken om ecosystemen te veranderen en te resetten. De gruwel van een xenomorf die de aarde bereikt is door de hele franchise heen gepest met de algemene consensus dat een dergelijke gebeurtenis zou leiden tot een uitstervingsgebeurtenis. Als deze hogere wezens echter zouden bestaan, hadden ze de xenomorf kunnen creëren als een vorm van goddelijke gerechtigheid. Op dit punt zullen fans echter moeten wachten om erachter te komen.
